14. augusta 1775 dekrétom ruskej cisárovnej Kataríny II. Bol Záporožský Sich konečne zrušený. Po opätovnom zjednotení významnej časti Malého Ruska s ruským štátom v roku 1654 boli armáde Záporožia rozšírené výsady, ktoré požívali ďalšie ruské kozácke jednotky. Záporožskí kozáci zohrali dôležitú úlohu. Kozáci bránili južné hranice Ruska a hrali významnú úlohu vo vojnách s Krymským Khanátom a Osmanskou ríšou. Kozáci si preto zachovali istú autonómiu od centrálnej vlády. Kozáci však utečencov, ktorí sa skrývali v Záporožskom Sichu, uchránili pred prenasledovaním cárskych úradov. Okrem toho hrozilo povstanie proti stredu, spojenectvo s vonkajšími nepriateľmi Ruska.
V roku 1709 teda koshevoj ataman Kost Gordienko a hejtman Mazepa podpísali spojeneckú zmluvu so švédskym kráľom Karolom XII. Zaporizhzhya Sich sa pripojil k aliancii Mazepa a Karla proti Rusku. Medzi kozákmi a ruskými jednotkami došlo k niekoľkým stretom. Peter dáva rozkaz princovi Menšikovovi, aby presunul tri pluky z Kyjeva do Sichu pod velením plukovníka Jakovleva, aby „zničil celé hniezdo výtržníkov“. Sich bol zničený a neskôr Peter nedovolil, aby bol znovu postavený. Kozáci založili na územiach ovládaných Turkami a krymskými Tatármi, Kamenskaya (1709-1711) a Aleshkovskaya Sich (1711-1734). Dlho však nevydržali.
V roku 1733, keď po vypuknutí vojny medzi Ruskou ríšou a Tureckom krymský chán nariadil kozákom z Aljoškovskej Sichi ísť na ruské hranice, generál Veisbakh (v tom čase sa zaoberal výstavbou ukrajinského línia pevností) odovzdal kozákom osvedčenie v trakte Krasny Kut, 4 versty zo starého Chertomlytskaya Sich. Kozáci dostali list od cisárovnej Anny Ioannovny o odpustení a prijatí do ruského občianstva. V dôsledku toho bol vytvorený Nový (Podpolnenskaya alebo Pidpilnyanskaya) Sich, ktorý existoval až do konečného zničenia Zaporozhye Sich v roku 1775.
Nový Sich sa veľmi líšil od starého. Stala sa nielen vojenským, ale aj ekonomickým a politickým organizmom. Kozáci dostali plnú samosprávu a pozemky na osídlenie. Objavili sa nové štruktúry - „palanques“. Išlo o akési „provincie“Sicha v Samare, Miusovi, Bugovi, Inguletovi atď. Každej palanke vládol plukovník, esaul a úradník, ktorí boli podriadení Koshovi. Bola to pôda, ktorá sa stala hlavným zdrojom príjmu kozákov, nie plat. V blízkosti sichských „zimákov“sa usadili - ženatí kozáci, nemali ani volebné právo v parlamente, ani právo byť zvolení do funkcie a boli povinní platiť „dym“do sichskej pokladnice, to znamená druh rodinnej dane. Okrem ženatých kozákov sa tak začali nazývať aj mimozemšťania (hlavne roľníci, chudobní ľudia, ktorí hľadali lepší život), ktorí pochádzali z veľkomoravských provincií, pravobrežnej Ukrajiny a tureckého majetku. Neboli považovaní za kozákov, ale boli poddanými Sicha, dodávali im jedlo a platili 1 rubeľ ročne. Obyvatelia Sichu sa živili rybolovom, poľovníctvom, chovom dobytka, poľnohospodárstvom a obchodom. Majster získal príjem z ciel na dovoz tovaru, vlastníctvo pôdy, pasienkov, rybolov.
Kozáci sa riadili iba svojimi vlastnými zákonmi, pre menšie záležitosti boli súdení v palietách, pre významné záležitosti - u koshevoya. Páchateľa bolo možné odovzdať cisárskym úradom, ale najčastejšie boli sami potrestaní až po trest smrti. Sich sa rýchlo stal jedným z prekvitajúcich regiónov Ruska. Palanquety boli pokryté dedinami a farmami.
V Sichi však existovali aj vážne rozpory medzi majstrom a golotom. Cárska vláda takmer okamžite porušila povinnosť každoročne vyplácať Sichovi 20 000 rubľov platu. Už v roku 1738 začali dávať iba 4-7 tisíc. Zostatok peňazí bol nariadený na zaplatenie z armádnych fondov, ale boli prázdne. V dôsledku toho úrady začali podvádzať - „verejne“vydali 4 000 rubľov, zvyšok peňazí bol tajne prevedený na majstrov, náčelníkov kurenov. Kozáci to však rýchlo zistili: v roku 1739 koshevoy Tukal a starší zvrhli, zbili a vyplienili svoj majetok (koshevoy bol tak veľmi zbitý, že čoskoro zomrel). V budúcnosti majstri naďalej bohatli. Najmä koshevoy Kalnyshevsky kedysi predal zo svojich stád 14 000 koní. Bežní kozáci boli v chudobe, všetky výhody išli v prospech majstra.
Obyčajní kozáci pracovali u majstra, lovili ryby a vyvíjal sa aj „gaidamastvo“, teda lúpež. V dolnom toku Bugu sa zbiehali ruské, turecké a poľské hranice, čo pomohlo skryť sa po plienení. V päťdesiatych a šesťdesiatych rokoch 17. storočia sa Gaidamache stala v tomto regióne skutočnou katastrofou. Ľudia sa jednoducho báli cestovať po regióne Bug. Z Turecka a Poľska sa hrnuli sťažnosti na kozákov. Pokyny cisárskych úradov jednoducho „brzdili“. Obchod bol veľmi výnosný a na podiele sa podieľali mnohí majstri a správa palán. Keď v roku 1760 Koshevoy Beletsky zorganizoval na nátlak ruských úradov nálet na zajatie lupičov, zatknúť sa podarilo iba 40 ľuďom. A dokonca aj potom kuren atamani zakázali ich rozdávanie, rozložili ich na kurens a po pokání ich prepustili. Keď ruské vojenské velenie ustanovilo hliadkovanie na hranici s pravidelnými jazdcami a prímestskými kozákmi, začali ozbrojené prestrelky.
Vznikol ďalší dôvod konfliktu medzi Sichom a ústrednou vládou. V tomto období došlo k aktívnemu rozvoju predtým prázdnych oblastí Divokého poľa a kozáci začali brániť svoje „zákonné“krajiny. Svoje tvrdenia založili na falošnom - „kópii listu Stefana Batoryho“, ktorý im údajne daroval pozemky pri meste Chigirin, pozdĺž Samary a južného Bugu, ľavého brehu Dnepra až po Seversky Donets. A keďže ruskí panovníci, počínajúc Alexejom Michajlovičom, potvrdili „bývalé záporožské slobody“, samotné slovo „slobody“sa začalo interpretovať v územnom zmysle. Záporožskí kozáci, ktorí bránili svoje „zákonné“krajiny, sa nezastavili pri použití sily. Vypálili niekoľko nových osád, rozohnali dedinčanov. V dôsledku toho sa kozáci jednoducho stali drzými a spochybňovali ústrednú vládu. Za vlády Alžbety a Hetmana Razumovského sa z toho dostali.
Za Kataríny II. Sa situácia zmenila. Vážne sa začala zaoberať záležitosťami uvoľnenej Ukrajiny. V roku 1763 Hetman Razumovsky, ktorý naznačil dedičný stav svojho postu, odstúpil „z vlastnej vôle“. Malé ruské kolégium bolo obnovené. Za jej prezidenta bol vymenovaný generál P. A. Rumyantsev. Našiel obraz úplného kolapsu na Ukrajine. Vojenská elita, ktorá vládla v mene Razumovského, sa úplne vymkla spod kontroly. Majstri sa zmenili na všemohúcich šľachticov, skutočných miestnych „kniežat“. Dostali sa do bodu, keď medzi sebou bojovali, napadli krajinu, vyzbrojili kozákov a roľníkov. Obyvateľstvo bolo podrobené nemilosrdnému vykorisťovaniu. Bežní kozáci buď skrachovali, zmenili sa na poľnohospodárskych robotníkov, alebo sa zaoberali osobným poľnohospodárstvom. Dekrét z roku 1721 o podpore kozáckej destilácie mal na vojská negatívny vplyv. Mnoho ľudí sa vypilo na smrť, iní vypili svoje pozemky na pitie. V dôsledku toho sa malá ruská armáda rozložila. Rumyantsev nedokázal zorganizovať ani poštu: bohatí nechceli slúžiť, chudobní nemali príležitosť.
Bolo potrebné prijať opatrenia na obnovenie bojaschopnosti miestnych vojsk. V roku 1764 začali kozácke jednotky transformovať na pravidelné. Z ukrajinských plukov bolo vytvorených 5 husárov: čierny, žltý, modrý, srbský a ugorský. Okrem toho boli vytvorené štyri pikinerské pluky (Elisavetgradsky, Dneprovsky, Donetsk a Lugansky). Neskôr bolo vytvorených niekoľko ďalších husárskych plukov a Landmilitia bola reorganizovaná na jednotky pechoty. Celkovo musela Ukrajina stratiť svoje špeciálne postavenie a byť zrovnoprávnená s inými ruskými provinciami. Sedieť v týchto plánoch bola vážna prekážka.
Pozornosť upriamila aj na „štát v štáte“- Záporožský Sich. V roku 1764 bol Kosh podriadený Malému ruskému kolégiu. Záporožskej administratíve sa pripisovalo zásluhy za to, že už neuskutočnil voľby. Kozáci boli rozhorčení a na rozdiel od pokynov usporiadali nové voľby a zvolili Kalnyševského za koshevského. Nový koshevoy odišiel do Petrohradu bez povolenia požadovať priamu podriadenosť Zahraničného kolégia a nastoliť otázku „legálnych“krajín Záporožia. Rumyantsev navrhol, aby cisárovná delegátov zatkla. Bol vypracovaný návrh reformy Sichu. Catherine však neprijala tvrdé opatrenia, blížila sa nová vojna s Tureckom, nechceli komplikovať situáciu na juhu. Cisárovná prijala delegáciu milostivo. Toto inšpirovalo kozákov, vrátili sa do Sichu a začali sa chváliť, že „vystrašili“vládu.
V roku 1767 bolo prijaté vypovedanie, že Koshevoy Kalnyshevsky a úradník Ivan Globa súhlasia so začatím rokovaní s tureckým sultánom, ak vláda nesplní ich požiadavky. Catherine nechala vypovedanie bez následkov, ale osud Sicha bol už vopred hotový. Riešenie problému sa iba odkladalo na koniec vojny s Osmanskou ríšou.
Samotné vedenie Sich zhoršilo jej neisté postavenie. Nielenže vyzvala ruské úrady, ale vstúpila do kontaktu aj s Krymom a Tureckom. V predvečer vojny dostali kozáci listy od Bakhchisarai a Istanbulu, v ktorých ich lákala možnosť presťahovať sa do služieb Turecka a sľubovali trojitý plat. V mene sultána navštívil Sich francúzsky emisár Totleben. Kalnyševskij odmietol Turkom, ale korešpondenciu neprerušil. Okrem toho umožnil Totlebenovi hovoriť s kozákmi a nezradil ho Rumyantsevovi. Medzi kozáckou masou začal zmätok. Keď v decembri 1768 dostali kozáci pokyn začať vojnu s Tureckom, vzbúrili sa. Kalnyševskij musel nielen potlačiť vzburu, ale požiadať o pomoc ruskú posádku z Novosechenského zatiahnutia. Nepokoje pokračovali niekoľko mesiacov, kozáci opustili hranice a Tatári v januári 1769 prerazili na Ukrajinu.
V rusko-tureckej vojne v rokoch 1768-1774. Zúčastnilo sa 10 000 kozákov (asi 4 000 ďalších zostalo na území Sicha). Vo vojne ukázali vysoké bojové vlastnosti, vyznamenali sa prieskumom a nájazdmi a hrali dôležitú úlohu v bitkách pri Large a Cahule. Víťazstvo v tejto vojne bolo ďalším dôvodom eliminácie Záporožskej armády. Po uzavretí dohody Kuchuk-Kainardzhiyskiy získala Ruská ríša prístup k Čiernemu moru, vytvorila sa obranná línia Dnepra a krymský Khanate bol na pokraji zničenia. Druhý historický nepriateľ Ruska, katolícke Poľsko, stratil moc a v roku 1772 došlo k jeho prvému rozdeleniu. Záporožskí kozáci stratili svoju úlohu obrancov južných hraníc.
V máji 1775 bol zbor generála Petra Tekeliho presťahovaný do Sichu. Operácia bola bez krvi. Starší, ktorí si uvedomili, že odpor je zbytočný, spolu s kňazmi upokojili radových kozákov. Dekrétom Kataríny bol Zaporizhzhya Sich zrušený. Bežní kozáci neboli prenasledovaní. Niektorí zostali na Ukrajine a usadili sa v dedinách a mestách. Niektorí z veliteľov dostali dôstojnícke hodnosti, z predákov sa stali šľachtici. Iba traja kozáci - Kalnyševskij, vojenský sudca Pavel Golovaty a úradník Globa boli odsúdení za obvinenie zo zrady a vyhostení do kláštorov. Kalnyshevsky žil v Soloveckom kláštore do veku 112 rokov a zomrel v roku 1803, pričom prevzal mníšsku dôstojnosť.
Časť kozákov odišla k Dunaju za vlády tureckého sultána a bol vytvorený zadunajský Sich. V roku 1828 prešli transdunajskí kozáci na stranu ruskej armády a boli osobne omilostení cárom Mikulášom I. Z nich bola vytvorená azovská kozácka armáda. V Rusku, počas vojny s Tureckom, Alexander Suvorov v rokoch 1787-1788. z kozákov bývalého Sicha a ich potomkov zorganizoval „Armádu verných Záporožcov“. V roku 1790 bol transformovaný na čiernomorskú kozácku armádu a potom získal územie ľavobrežného Kubanu. Kozáci sa aktívne zúčastňovali na kaukazskej vojne a ďalších vojnách Ruskej ríše.
